第382章 原生生物界门下纲（1/2）
原生生物界门下纲：
原生生物中SAR超群之不等鞭毛门：
不等鞭毛门（heterokonhyta 或 Stranopiles）是一个多样化的类群，包含光合作用和非光合作用的原生生物。其分类体系可能因研究进展而调整，但目前公认的主要纲如下：
1. 光合作用的纲（含叶绿体，通常为藻类）
硅藻纲（bacilriophyceae）
单细胞或群体，细胞壁由硅质壳组成，海洋和淡水生态系统中重要初级生产者。
金藻纲（chrysophyceae）
多数为淡水种类，部分具硅质鳞片或鞭毛，如金藻（Golden algae）。
黄藻纲（xanthophyceae）
淡水和潮湿土壤中常见，色素以叶绿素c和β胡萝卜素为主（如黄绿藻）。
褐藻纲（phaeophyceae）
大型多细胞海藻（如海带、昆布），含岩藻黄素，是重要的海洋生态系统组成。
定鞭藻纲（prynesiophyceae 或 haphyceae）
部分分类系统将其归入独立门，但传统属于不等鞭毛类，如颗石藻（olithophores）。
针胞藻纲（Raphidophyceae）
淡水或海洋种类，部分有毒（如赤潮生物）。
2. 非光合作用的纲（无叶绿体）
卵菌纲（ooycetes）
类似真菌但亲缘关系远，包括植物病原体（如马铃薯晚疫病菌 phyhthora）。
丝壶菌纲（hyphochytrioycetes）
寄生或腐生，菌丝体简单，与卵菌近缘。
蛙片菌纲（bisoecida）
自由生活的单细胞鞭毛虫，通常附着在基质上。
伪真菌纲（Labyrthuloycetes）
包括网黏菌（Labyrthu）和破囊壶菌（thratochytriu），部分产生oga3脂肪酸。
领鞭毛虫纲（ofgellida，部分分类归入此处）
与动物界近缘，但形态学上曾归为不等鞭毛类。
其他争议或小纲
pegophyceae（浮游藻类，如褐胞藻）
Etigahyceae（淡水或土壤中的微藻）
dictyochophyceae（硅鞭藻类，部分为化石种类）
注意事项
分类可能因分子系统学研究更新（如部分类群被重新划分）。
非光合作用的类群（如卵菌）曾长期被误认为真菌，现通过基因证据归入不等鞭毛门。
囊泡虫门（Alveota）包括三个主要亚门：甲藻亚门（dofgelta）、顶复亚门（Apiplexa） 和 纤毛虫亚门（ciliophora）。以下是各亚门的主要纲的分类（基于当前主流分类系统，可能因研究进展有所调整）：
1. 甲藻亚门（dofgelta）
甲藻多为单细胞，部分具光合作用（如共生甲藻 Sybiodiu），部分为异养或寄生。主要纲包括：
光合型甲藻（dophyceae 及相关类群）
dophyceae（甲藻纲）
典型甲藻，含叶绿素a\/c，如夜光藻（Noctica）、多甲藻（peridiu）。
包括许多赤潮生物（如 Alexandriu、Karenia）。
Syndiophyceae（共甲藻纲）
寄生性甲藻，无叶绿体，如 Aoebophrya（感染其他甲藻）。
非光合型甲藻
Nocticiphyceae（夜光藻纲）
异养型，如 Noctica stilns（生物发光种类）。
bstodiphyceae（芽甲藻纲）
寄生在海洋无脊椎动物体内，如 bstodiu。
2. 顶复亚门（Apiplexa）
顶复类全部为寄生生物，具顶复合体结构（用于入侵宿主细胞）。主要纲包括：
传统分类
oidasida（锥状体纲）
idia（球虫纲）
细胞内寄生，如 Eiria（禽类球虫）、toxopsa gondii（弓形虫）。
haeosporidia（血孢子虫纲）
由吸血昆虫传播，如 psodiu（疟原虫）、babesia（巴贝虫）。
Aoidasida（无锥体纲）
无顶复合体锥状结构，如 piropsida（焦虫纲，包括 theileria）。
其他（近年调整）
Gregaria（簇虫纲）
寄生在无脊椎动物肠道，如 Gregara。
cryptosporidiidae（隐孢子虫科，有时独立分类）
如 cryptosporidiu parvu（人类腹泻病原体）。
3. 纤毛虫亚门（ciliophora）
纤毛虫以纤毛运动，具大核和小核，种类繁多。主要纲（基于分子系统学调整）：
传统分类（部分已调整）
Karyorelictea（核残纲）
大核不分裂，如 Loxodes（淡水种类）。
heterotrichea（异毛纲）
纤毛复杂，如 Stentor（喇叭虫）、blepharisa（赭纤虫）。
Spirotrichea（旋毛纲）
包括：
oligotrichida（寡毛目）（如 Strobidiu）
hypotrichida（下毛目）（如 Euplotes、oxytricha）
choreotrichida（游毛目）（浮游种类，如 ttnidiu）
Litostoatea（裸口纲）
胞口无复杂结构，如 didiu（掠食草履虫）、bantidiu li（人体寄生种类）。
phyllea（叶咽纲）
具叶状咽部，如 chilodonel（鱼类寄生虫）。
Nassophorea（篮口纲）
如 Nassu（摄食蓝藻）。
oligohynophorea（寡膜纲）
包括：
hynostoatida（膜口目）（如 tetrahyna）
peritrichida（缘毛目）（如 Vorticel、钟虫）
Apostoatida（离口目）（寄生甲壳动物）
prostoatea（前口纲）
胞口位于前端，如 leps。
分子系统学新分类
近年研究将纤毛虫分为 postahora（如异毛纲、核残纲）和 Intraaucleata（其他大部分类群），但传统纲级分类仍广泛使用。
有孔虫门（Foraifera）是一类具有钙质或有机质外壳（壳室）的海洋原生生物，广泛分布于现代和古代海洋沉积物中。根据壳质结构、形态和分子系统学研究，其分类体系不断更新。以下是目前公认的主要纲（css）和重要亚类群：
1. 传统形态分类（基于壳质成分和结构）
(1) 有机质壳纲（Allogroiida \/ Allogroiia）
壳质类型：有机质（蛋白质或多糖），无矿物质。
代表：Allogroia（原始有孔虫）。
生态：浅海或淡水环境。
(2) 胶结壳纲（texturiida \/ texturia）
壳质类型：胶结颗粒（如砂粒、矿物碎片）黏合而成。
代表：texturia、trochaa。
生态：常见于潮间带至深海。
(3) 钙质微孔壳纲（Fulida?）
壳质类型：钙质（方解石），壳室复杂，已灭绝。
代表：Fula（石炭纪二叠纪标准化石）。
生态：古生代海洋。
(4) 钙质透明壳纲（Globothaa）
壳质类型：透明钙质（方解石），多房室。
亚纲\/目：
Rotaliida（轮虫目）：如 Aonia、Elphidiu（潮间带常见）。
Globigerida（抱球虫目）：浮游种类，如 Globigera（深海沉积重要组分）。
(5) 钙质不透明壳纲（tubothaa）
壳质类型：不透明钙质（文石或高镁方解石）。
亚纲\/目：
iliolida（粟米虫目）：如 ququeloa、Sorites（热带浅海常见）。
2. 分子系统学新分类（21世纪更新）
近年分子研究表明，传统形态分类需调整，目前主流分为 2个主要纲：
(1) 球房虫纲（Globothaa）
包含 Rotaliida、Globigerida 等，壳多为透明钙质
典型代表：Globigeroides（全球大洋浮游种）。
(2) 管房虫纲（tubothaa）
包含 iliolida，壳为不透明钙质（文石）。
典型代表：peneroplis（珊瑚礁共生种）。
3. 其他重要类群
onothaa（单房室纲）：
单室壳，如 Astraa（胶结壳）和 Groia（争议归属，部分归入Rhizaria）。
xenophyophorea（巨型深海有孔虫）：
深海沉积物中的巨型种类（可达20），分类地位尚不明确。
4. 生态与地质意义
现代生态：底栖（90%）、浮游（如抱球虫），部分与珊瑚共生。
化石记录：从寒武纪延续至今，是石油勘探的生物地层标志（如 Fula、Nuulites）。
争议与待定类群
“Nodosariida”（节房虫目）：传统归入tubothaa，但分子证据可能需重组。
“Lagenida”：部分学者视为独立目，壳为单列房室。
放射虫门（Radioria）是一类具有硅质骨架或有机质骨架的海洋浮游原生生物，属于SAR超类群中的囊泡虫类近缘分支（与有孔虫同属根足虫总门）。其分类体系复杂，传统上分为 2大类（基于骨架形态和细胞结构），现代分子系统学进一步细化。以下是目前公认的主要纲（css）和重要类群：
1. 传统形态分类（两大纲）
(1) 多囊虫纲（polycystea）
特征：硅质骨架呈网格状、放射对称，细胞质分中央囊（tral capsule）和外质层。
主要目\/亚纲：
Spulria（泡沫虫目）
骨架球形或放射对称，如 Aa、hexastys（常见于深海沉积物）。
Nasselria（罩笼虫目）
骨架呈钟形或锥形，具极轴（如 cyrtocapsel、Eucyrtidiu）。
llodaria（胶体虫目）
骨架退化或缺失，形成胶状群体（如 ）。
(2) 稀孔虫纲（phaeodarea \/ phaeodaria）
特征：骨架由有机质（二氧化硅+蛋白质）构成，中央囊具暗囊（phaeodiu）。
代表：Autha、tcarora（深海种类）。
注：分子证据显示其可能不属于放射虫，需重新归类。
2. 分子系统学新分类（21世纪调整）
近年研究将放射虫分为 3个独立纲（部分类群被移出）：
(1) 多囊虫纲（polycystea）
保留传统Spulria、Nasselria和llodaria。
分子标记：18S rRNA支持其单系性。
(2) 稀孔虫纲（phaeodarea）?
可能属于cerzoa（丝足虫类），非真正放射虫。
(3) 棘刺虫纲（Atharea）
特征：骨架由硫酸锶（SrSo?）构成，星状或放射对称。
代表：Athotra、Lithoptera。
生态：热带海洋浮游，光合共生（与定鞭藻共生）。
3. 其他争议类群
taxopodida（列足虫）：如 Sticholonche，曾归入放射虫，现属heliozoa（太阳虫类）。
phaeogroida：稀孔虫的亚类，分类地位未定。
4. 生态与地质意义
现代分布：热带大洋浮游，深度米（光合共生）或深海。
化石记录：从寒武纪延续至今，硅质骨架构成放射虫软泥（深海沉积物）。
古气候指标：如 cyrtocapsel 用于重建古海洋温度。
丝足虫门（cerzoa）是一大类形态多样的原生生物，属于 SAR超类群 中的 根足虫类（Rhizaria）。它们以 丝状伪足（filopodia） 为特征，广泛分布于淡水、海洋和土壤环境。根据分子系统学和形态学，cerzoa 的分类体系近年变化较大，以下是当前公认的主要 纲（css） 和重要类群：
1. 核心分类（基于分子系统学）
(1) 丝足纲（Filosa）
特征：具细长丝状伪足，无硬质骨架。
主要亚纲\/目：
Ibricatea（覆瓦纲）
部分种类具有机鳞片，如 Euglypha（淡水种类，壳由硅质鳞片组成）。
thefilosea（鞘丝纲）
具有机或硅质外壳，如 tectofilosida（海洋底栖）。
Ventrifilosa（腹丝纲）
伪足从细胞腹侧伸出，如 Vapyrellida（“吸血鬼变形虫”，寄生藻类）。
(2) 内生粘菌纲（Endoyxa）
特征：部分类群为寄生或腐生，伪足较短。
主要目：
psodiophorida（根肿菌目）
植物病原菌，如 psodiophora brassicae（甘蓝根肿病）。
phytoyxea（植粘菌目）
寄生藻类或植物，如 phagoyxa。
2. 其他重要类群（部分归属未定）
(3) 网足虫纲（Granofilosea）
特征：具颗粒状伪足，部分种类形成网状结构。
代表：Leudi（海洋种类）。
(4) 太阳虫纲（helioonadida \/ helioonads）
特征：具放射状伪足，曾归类于太阳虫（heliozoa），现归入cerzoa。
代表：helioonas。
(5) 拟辐足纲（proteoyxidea）
特征：伪足形态介于丝足虫和变形虫之间。
代表：pseudospora（寄生藻类）。
(6) 原壳虫纲（chloraraiophyceae）
特征：含叶绿体（二次内共生获得），伪足发达。
代表：chloraraion（海洋光合种类）。
3. 争议类群
phaeodarea（稀孔虫）：传统归入放射虫，分子证据支持其属于cerzoa。
Groiida（格罗米虫）：部分学者归入cerzoa，但可能属于有孔虫近缘类群。
4. 生态与演化意义
多样性：从自由生活（如 Euglypha）到寄生（如根肿菌）。
生态功能：海洋沉积物中的重要微生物捕食者，部分参与碳循环。
演化地位：与 有孔虫（Foraifera） 和 放射虫（Radioria） 同属 Rhizaria，但伪足结构更简单。
原生生物中古虫界之眼虫门：
眼虫门（Euglenozoa）是一大类具有显着运动特征的鞭毛虫类原生生物，广泛分布于淡水、海水及寄生环境中。其分类基于形态、超微结构及分子系统学，目前主要包括 4个主要纲，部分类群仍存在争议。以下是当前公认的分类体系：
1. 核心分类（基于分子系统学）
(1) 眼虫纲（Euglenida \/ Euglenophyceae）
特征：
具 12根鞭毛，部分种类含叶绿体（二次内共生获得，如 Euglena）。
细胞表面具 螺旋状条纹（pellicle），可变形运动。
主要类群：
光合型（光自养）：
Euglena（眼虫，淡水常见）、phac（扁眼虫）。
异养型（吞噬或腐生）：
peranea（无叶绿体，捕食细菌）、heteronea。
寄生型：
Astasia（类似眼虫但无色，寄生或腐生）。
(2) 动基体纲（Kiopstea）
特征：
具 动基体（kiopst）（线粒体dNA高度浓缩）。
鞭毛基部有 副鞭毛体（paraxial rod）。
主要类群：
自由生活：
bodo（淡水或海洋，捕食细菌）。
寄生重要病原体：
trypanosoa（锥虫，如 t. brucei 致非洲昏睡病）。
Leishania（利什曼原虫，致黑热病）。
(3) 双鞭毛纲（diplonea）
特征：
具 两条不等长鞭毛，线粒体嵴呈 盘状。
海洋浮游或寄生。
代表：
diplonea、Rhynchop（寄生鱼类或无脊椎动物）。
(4) 副基体纲（postgaardea）
特征：
鞭毛系统高度特化，细胞后端具 “尾部”结构。
深海或极端环境分布。
代表：
postgaardi（深海沉积物中发现）。
2. 争议或待定类群
Sybiontida（共生虫纲）：
与双壳类动物共生的鞭毛虫，可能属于Euglenozoa基部类群。
heistasia：
无叶绿体，分类地位未定，曾归入Euglenida或独立分支。
3. 生态与医学意义
光合贡献：淡水中的 Euglena 是初级生产者。
病原体：
trypanosoa 和 Leishania 是重要人类寄生虫。
trypanosoa cruzi 致南美恰加斯病。
生物指示：Euglena 用于水质监测（富营养化指标）。
后滴门（taonada）是一类缺乏典型线粒体的厌氧性原生生物，主要生活在低氧或厌氧环境（如动物肠道、淡水沉积物）。它们的运动通常依赖多鞭毛或轴杆（axostyle）结构，并通过氢化酶体（hydrogenoso）代替线粒体进行能量代谢。根据分子系统学和超微结构特征，后滴门目前分为 3个主要纲，部分类群的分类仍在调整中。以下是详细分类：
1. 核心分类（基于分子系统学）
(1) 双滴虫纲（diploonadida）
特征：
双核结构（两个细胞核对称排列）。
具 4对鞭毛（8根），无高尔基体和线粒体。
通过氢化酶体代谢。
代表类群：
Giardia（贾第虫）：人类肠道寄生虫，致贾第虫病（如 G. blia）。
Spironucle：寄生鱼类，致“旋核病”。
(2) 副基体纲（parabasalia \/ parabasa）
特征：
具 轴杆（axostyle）（微管组成的支撑结构）。
鞭毛数量多（通常4根以上），部分种类有副基纤维（parabasal fibers）。
含氢化酶体。
主要目\/亚纲：
trionadida（毛滴虫目）：
trionas vagalis（阴道毛滴虫）：性传播病原体。
tripha：白蚁肠道共生，协助纤维素消化。
hyperastigida（超鞭毛目）：
鞭毛极多（数百根），如 ixotricha（与白蚁共生）。
(3) 锐滴虫纲（carpedieonadida）
特征：
单核，具 2根鞭毛（一根向前，一根向后）。
自由生活于淡水或海洋沉积物。
代表：
carpedieonas：无寄生性，形态简单。
2. 争议或待定类群
Retortaonadida（曲滴虫纲）：
曾归入后滴门，现部分研究认为其更接近 异鞭毛门（heterolobosea）。
代表：Retortaonas（寄生蛙类肠道）。
Anaeraoebidae：
无鞭毛的厌氧变形虫状生物，分类地位未定。
3. 生态与医学意义
寄生与共生：
Giardia 和 trionas 是重要人类病原体。
tripha 等与白蚁\/蟑螂共生，协助木质素分解。
演化意义：
后滴门是真核生物早期分支（Excavata超类群），保留原始特征（如无典型线粒体）。
副基体门（parabasalia或parabasa）是一类厌氧性原生生物，主要特征是具有氢化酶体（代替线粒体）、轴杆（axostyle）以及副基纤维（parabasal fibers）。它们通常具有多鞭毛，许多种类是共生或寄生的，生活在动物肠道或生殖道等厌氧环境中。
副基体门（parabasalia）的主要纲
目前，副基体门主要分为 2个纲，基于鞭毛数量、超微结构和分子系统学：
1. 毛滴虫纲（trionadea）
特征：
通常有 4~6根鞭毛（1根后鞭毛，其余前鞭毛）。
具有副基纤维（parabasal fibers），支持鞭毛运动。
轴杆（axostyle）明显，由微管束组成，贯穿细胞。
主要类群：
毛滴虫目（trionadida）：
trionas vagalis（阴道毛滴虫）——人类性传播病原体。
trionas gallae（禽毛滴虫）——感染鸟类口腔和消化道。
dientaoeba fragilis（双核阿米巴，部分研究归入此类）——人类肠道寄生虫。
单毛滴虫目（onoadida）：
onoas——寄生爬行动物肠道。
2. 超鞭毛纲（hyperastigia \/ hyperastigea）
特征：
鞭毛数量极多（数十至数百根），呈螺旋或簇状排列。
细胞较大，通常与白蚁或蟑螂共生，帮助消化纤维素。
无典型的副基纤维，但仍有氢化酶体。
主要类群：
旋毛滴虫目（Spirotriphida）：
Spirotripha——白蚁肠道共生。
多鞭毛目（polyastigida）：
ixotricha paradoxa（混合鞭毛虫）——白蚁共生，依赖细菌辅助运动。
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